推拿科创建于1956年，创始人为全国著名老中医，第一批国务院特殊津贴获得者朱金山先生。“朱氏推拿”现为江苏省非物质文化遗产，科室现有副主任中医师3人，主治中医师5人，中医师5人，治疗师2人。科室中医特色鲜明，以中医、推拿、针灸学为主要理论指导，以成人推拿、小儿推拿及康复治疗为主，开展推拿手法、牵引、整脊、拔罐、针灸疗法、放血、小针刀等中医特色疗法及关节松动、理疗等康复治疗技术，此外还开展徒手整形、产后康复、催乳、通乳、骨盆整复等新技术。此外科室还引进：冲击波治疗仪、冷疗、中低周波治疗仪、深层肌肉治疗仪DMS、脉冲整脊枪、盆底康复治疗仪、乳腺治疗仪等。主治颈椎病、腰椎间盘突出、急性腰扭伤、慢性腰肌劳损、落枕、网球肘、膝关节骨性关节炎、肩周炎、背肌筋膜炎、腱鞘囊肿、耳鸣、萎缩性胃炎、亚健康、肥胖症、失眠、头痛、眩晕、消化不良等疾病；小儿推拿，是以治疗小儿斜颈、腹泻、呕吐、便秘、消化不良、厌食、咳喘、感冒、发热、夜啼、桡骨小头半脱位等相关疾病为主，是科室经典治疗项目，在全省享有盛誉。
长期作为南京市中医药大学针灸推拿教研室，带教南京中医药大学、澳门科技大学、南方医科大学、南京盲校、南京卫生高等职业学校等院校本、专科实习生和护理实习生，以及澳大利亚、意大利、法国、比利时、挪威、南非、马来西亚、俄罗斯、美国等国外医师培训，还承担进修、住院医师规范化培训、全科医师规范化培训、基层卫生人员培训等人才培养工作。