南京市中医院骨伤科成立于1956年，由全国名老中医、首批享受国务院政府特殊津贴的高级专家朱金山主任主导并创建正骨、推拿学科，同时培养了南京市名中医李裕顺等一批中医骨伤名家。70年代初，在朱金山主任的指导下，骨伤科开设了正骨和骨伤门诊，李裕顺主任担任科室负责人。80年代起，由尹秀祥主任担任骨伤科主任，此后担任骨伤科主任的依次为余有映、朱福德、杭柏亚、尹宏、俞宁。
现任骨伤科主任赵建宁，副主任俞宁、杭柏亚、钱卫庆，主任助理孙欣、王军，护士长王婷婷、孟贤、周娟。
赵建宁，主任医师，教授，南京大学等5所高校博士生导师。享受国务院政府特殊津贴，中国医师奖获得者，江苏省有突出贡献中青年专家。担任江苏省医学会骨科学分会主任委员，中国医师协会骨科分会常委兼关节外科副组长。
科室现为江苏省中医重点专科，国家药物临床试验机构资格认定单位，南京中医药大学硕士学位授予点，南京市伤残鉴定定点单位，南京中医药学会骨伤专业委员会主任委员单位，南京市中医护理专科护士培训基地，南京市中医护理适宜技术培训基地。科室设有3个病区，开展床位135张，分4个亚专业，即创伤骨科、关节外科与运动医学、脊柱外科、骨与关节感染外科。坚持中医中药治疗为主，突出中医特色，中西并重，中西医结合治疗各类骨科疾病。骨折与脱位的手法整复、中医中药口服与外用、微创及修复重建手术治疗；骨关节炎的中医中药非手术治疗，人工关节置换及翻修：包括复杂先天性髋关节脱位（DDH）、类风湿关节炎、强直性脊柱炎、严重关节畸形等，关节急慢性运动损伤的关节镜微创治疗；脊柱及相关疾病的中医正骨疗法、中医中药非手术治疗以及微创手术治疗；骨与关节感染、骨髓炎的综合治疗及糖尿病足保肢治疗。
科室设有门诊、急诊、中医综合治疗室，西医治疗室、石膏房、骨密度测定室、肌电图室等。拥有C臂机、关节镜、椎间孔镜、双能X线骨密度检测仪、神经电生理检测仪、多普勒超声检测仪等各类设备。每年门急诊量在5万余人次，收治病人3000余人次，手术2200余台。
科室现有医护人员67人，医生34人，其中博、硕士生导师5名，副高以上职称17人，硕士以上学历占60%；护士33人。承担各类科研项目22项，其中国家级、省级以上课题3项。发表核心期刊学术论文125篇，其中SCI论文14篇，总IF>50分。获国家专利36项。承担南京中医药大学理论教学和实习带教，以及香港大学、澳门科技大学、南方医科大学本科临床实习带教，是江苏省住院医师规范化培训基地。