南京市中医院输血科于2019完成独立建制，2024年获批南京市医学重点专科，形成了配发血、出凝血检验、输血相关治疗和献血服务等亚专科。现有工作人员9人，其中高级职称2人，中级职称4人，初级职称3人；博士1人、硕士3人，本科5人。输血科根据《中华人民共和国献血法》、《医疗机构临床用血管理办法》和《临床输血技术规范》等法规，建立了ISO15189质量管理体系，输血管理系统覆盖临床输血全过程，与南京市红十字血液中心共建献血屋，实现科学、合理、安全、有效用血。输血科在江苏省输血科中最早开展富血小板血浆（PRP）疗法，2023年9月开设输血科门诊。
开展的检验项目：ABO血型鉴定、Rh抗原分型检测、交叉配血、不规则抗体筛查/鉴定、Coombs试验、抗体效价测定、血栓弹力图试验（TEG）、凝血和血小板功能动态监测、新血栓四项、血小板闭合时间检测、血小板抗体检测、抗血小板药物监测、红细胞叶酸测定、血小板CD分子测定。
开展的治疗技术：储存式自体输血、术前深度自体红细胞单采、治疗性红细胞单采、治疗性血小板单采、富血小板血浆（PRP）单采、富血小板血浆（PRP）疗法、血浆置换。
教学科研：招收南京中医药大学中西医结合硕士研究生，承担南京中医药大学本科生、研究生《外科学》“输血”部分的理论教学，每年招收输血医学和医学检验的实习生和进修生。2022年至2024年获批省市科研项目6项，发表学术论文24篇，参编输血顶级著作《中华输血学》第二版和多篇专家共识，已完成GCP临床试验3项。